DOSSIER Maladies émergentes11 avril 2025

ESCMID Global 2025: au cœur des avancées mondiales en infectiologie

Du 11 au 15 avril 2025, Vienne accueille ESCMID Global 2025, le congrès annuel de la Société européenne de microbiologie clinique et des maladies infectieuses. Cet événement majeur réunit les experts internationaux autour du VIH de l’infectiologie et des maladies émergentes.

Gilles Pialoux, notre rédacteur en chef, suivra la conférence sur place pour Vih.org, grâce à notre partenariat avec l’ANRS-Maladies infectieuses émergentes.

Sommaire

17 avril 2025

Cas cliniques de parasites atypiques

« Unusual presentations of unusual parasites ». Le titre de la session m’a suffisamment interloqué pour me donner envie d’y assister… Et elle a tenu ses promesses ! La session était présidée par Emmanuel Bottieau (Belgique) et Marcelo Victor Radisic (Argentine).

Par Didier Jayle, vih.org

Conférence ESCMID Infection bactérienne Recherche

Dermanyssus Gallinea

Le premier cas présenté par Jacques Sevestre (IHUMI de Marseille, institut bien connu depuis le covid-19 et ses travaux sur l’hydroxychloroquine…) est celui d’une femme de 78 ans qui présente une éruption urticarienne très prurigineuse notamment la nuit et le matin, qui avait débuté 3 jours auparavant. Dans ses antécédents, un pemphigus contrôlé par 5 mg/j de prednisone, un récent voyage à Punta Cana (République dominicaine), retour 5 jours avant. À l’examen, rash maculo-papuleux modéré avec lésions de grattage, au niveau du torse, de la taille, des épaules et des hanches. La patiente habite au 3^e étage d’une maison d’Aix-en-Provence, n’a pas d’animal domestique, n’a pris aucun nouveau traitement, n’utilise pas de cosmétiques ni de détergents.

Le diagnostic de gale n’est pas retenu devant la topographie des lésions et l’absence de contact. Les punaises de lits non plus, car il y a une atteinte de zones couvertes par les vêtements. Dans son mode de vie, rien de particulier, elle regarde la télévision, joue au Sudoku, fait des balades, et… elle nourrit des pigeons sur son balcon. L’équipe, ce qui est très inhabituel en France, se rend au domicile de la patiente pour une enquête entomologique. Sur la couverture de lit, on aperçoit un minuscule pou brun rougeâtre qui s’enfuit. En inspectant le balcon, sur le pot de fleurs, une multitude de petits acariens grouillent sur le bord du pot, à peine visible à l’œil nu. Il s’agit de Dermanyssus Gallinea, un arthropode acarien hématophage qui se nourrit du sang des oiseaux ; leur corps blanc-grisâtre devient brun-rougeâtre après leur repas. Ils peuvent piquer les mammifères, mais ne s’y incrustent pas.

Après enlèvement des pots du balcon, lavage des draps à 60° des linges et traitement des tapis à la vapeur, un insecticide (pyréthrinoïde) est pulvérisé sur le balcon et les fenêtres. Sous antihistaminiques, la patiente guérit rapidement.

Photographie microscopique d’un specimen de Dermanyssus gallinae, obtenu dans ala chmabre de la patiente, ESCMID 2025

Dermanyssus est bien connu des éleveurs de poules ou de pigeons. D’après Jacques Sevestre, il n’est pas un vecteur pour d’autres pathogènes. Les rashs dus à Dermanyssus Gallinea ne sont pas exceptionnels, souvent diagnostiqués gale ou attribués aux punaises de lits, c’est l’enquête entomologique qui permet le diagnostic.

J’ai moi-même une histoire avec Dermanyssus Gallinea. Mon fils qui vit à la campagne élève quelques poules. Un soir, je vais chercher des œufs dans le poulailler et les rapporte à la maison. À peine arrivé dans la maison qui est à 50 mètres du poulailler, je ressens des fourmillements intenses et une sensation prurigineuse sur le visage, le cou et le cuir chevelu. Sur moi, je ne vois rien. Je deviens hystérique, et me gratte partout. Je prends une douche, qui calme un peu les démangeaisons, mais incomplètement. En regardant très attentivement dans le miroir avec une loupe de dermatologue, au niveau d’un fourmillement, j’aperçois un minuscule point noir qui bouge ! Le lendemain, mon fils m’apprend qu’il y a des poux rouges dans le poulailler. Les poules n’y entrent plus, elles dorment dehors, elles mangent peu, maigrissent et s’affaiblissent (elles deviennent anémiques). En examinant les poules, il est facile de voir les poux rouges, gorgés du sang des gallinacés.

Les insecticides les plus fréquemment utilisés par les éleveurs sont : le vinaigre blanc qui repousse les acariens, la terre de diatomée, pulvérisée dans le poulailler et sur les poules. On peut aussi essayer une arme biologique et lâcher un autre acarien, Androlis, qui se nourrit des poux rouges et ne s’attaque pas aux poules. Un acaricide et insecticide, Exzolt (fluralaner) très efficace, peut être prescrit par les vétérinaires. Il est mélangé à l’eau bue par les oiseaux, parfois, il est aussi pulvérisé dans les poulaillers.

Myiases

La deuxième présentation par Robert Johnson (Université d’Alabama, Birmingham et Institut de médecine tropicale Alexander von Humboldt, Lima, Pérou) concernait une femme péruvienne de 77 ans, qui se plaint de douleurs pelviennes et génitales associées à des saignements vaginaux et une dysurie. Elle dit avoir vu des vers sortant de son vagin et a appliqué une pâte au basilic (méthode traditionnelle contre les myiases). Dans ses antécédents, diabète type 2, hypertension artérielle, prolapsus utérin depuis vingt ans. Vit en famille à Lima, pas de voyages. L’examen clinique, normal par ailleurs, retrouve un nid de larves de 3X4 cm au niveau du prolapsus.

Le bilan biologique est normal sauf E. Coli à l’ECBU. Elle a été traitée avec succès par une association metronidazol/ciprofloxacin + ivermectine par voie orale. Les larves ont été retirées mécaniquement.

Les myiases sont dues à une infestation par les larves de différentes espèces d’arthropodes de l’ordre des diptères. Les larves infectent différents tissus de l’hôte, d’où diverses présentations cliniques en fonction de l’espèce de mouche impliquée. Fréquentes en zones tropicales, elles se rencontrent en Europe chez des personnes de retour de ces pays tropicaux. En Amérique centrale et en Amérique du Sud, la mouche Dermatobia s’attaque aux primates (dont l’homme) donnant des furonculoses. En Guyane, on appelle sa larve «ver macaque».

Diaporama de Robert Johnson présenté le 13 avril à l’ESCMID Global

Une autre myiase est causée par Cochliomyia hominivorax¹, appelée aussi lucilie bouchère ou communément mouche à viande ou mouche de Libye, qui s’accompagne de fièvre, de prurit, d’adénopathie, de la sensation des mouvements de la larve sous la peau et parfois d’intenses douleurs. Les œufs sont pondus dans des plaies ouvertes ou des orifices naturels du corps (nez, oreilles). Elle est favorisée par une mauvaise hygiène ou par des blessures. La larve se nourrit exclusivement de tissus vivants. Les myases génitales comme celle qui vient d’être décrite sont rares, mais probablement sous-déclarées, elles surviennent chez des sujets en situation de précarité, et de faible accès aux soins. Elles peuvent se compliquer d’infections (mortalité 5%).

Neurognathostomiasis

La troisième observation est thaïlandaise, est présentée par Chatrawe Norsungnern (Chulalongkorn Memorial Hospital, Bangkok).

C’est une femme de 67 ans, Laotienne vivant à Bangkok, sans antécédents particuliers. Notion d’ingestion de grenouilles, de serpents, crus ou peu cuits et de rats. Elle souffre de céphalée temporale gauche, accompagnée de nausées et de vomissements depuis une semaine et qui s’aggrave. Pas de fièvre. À son admission, un scanner cérébral retrouve une zone d’hypodensité temporo-occipitale gauche. Le diagnostic d’accident ischémique subaigu est porté et la patiente repart chez elle avec un rendez-vous d’IRM. Dans les jours qui suivent, son état s’aggrave, les céphalées sont plus intenses, elle devient somnolente, et sa famille la ramène aux urgences. Outre la somnolence, l’examen retrouve une raideur de la nuque. La numération montre une hyperéosinophilie à 18% (1140/mm²). L’IRM montre des signes d’hémorragie cérébrale dans le lobe pariéto-temporal gauche. La ponction lombaire réalisée en raison des signes méningés retrouve un liquide xanthochromique, cellulaire (2649/mm²) polynucléaires et éosinophiles. Et un immunoblot positif dans le sérum et le LCR pour Gnathostoma. Le diagnostic de Neurognathostomiasis (Gnathostoma spinigerum) est porté et la patiente est traitée par albendazole 400mg/j pendant 21 jours + dexamethasone IV. Les signes cliniques et radiologiques vont s’améliorer progressivement dans les semaines qui suivent.

Présentation de C. NORSUNGNERN, le 13 avril à l’ESCMID Global

Gnathostoma est un parasite qui touche les petits carnivores comme le chat ou le chien, plus rarement l’homme, en Asie du Sud-Est. Elle est principalement transmise par la consommation de poissons d’eaux douces insuffisamment cuits. Quelques jours après l’ingestion, la larve migre dans la cavité abdominale, entraînant douleurs épigastriques, perte d’appétit, vomissement, parfois fièvre. Ensuite, elle peut migrer dans les tissus sous-cutanés, le plus souvent au niveau de l’abdomen, causant douleurs, prurit et œdème localisé. Après quelque semaines, le parasite se déplace et les symptômes apparaissent à un autre endroit. Il peut s’installer dans les viscères, le rein, le cerveau, les yeux en fonction du site de migration.

15 avril 2025

Long acting dans l’infection VIH

Une session sur les Long acting injectables pour prévenir ou pour traiter une infection a pris un exemple que nous connaissons bien: celui du VIH! C’est nouveau en infectiologie, on connaissait le Long acting pour la contraception, pour les troubles psychiatriques, pour les addictions, mais pas pour les maladies infectieuses.

Par Didier Jayle, vih.org

Conférence ESCMID Traitements Vivre avec le VIH

Rien de très nouveau pour Vih.org, mais une belle synthèse sur les apports de ces nouveaux traitements et une question épineuse: quid de ceux qui échappent virologiquement, 1% environ, avec une très large résistance.

Alors que les traitements antirétroviraux (ART) réussissent à supprimer la charge virale avec de moins en moins de comprimés, une seule fois par jour, et beaucoup moins d’effets secondaires que les premiers traitements, qui rendent à nouveau la médecine triomphante après la descente aux enfers 1982-1996, quels problèmes ne sont pas encore réglés?

Pedro Cahn, de l’Hôpital Juan Fernandez de Buenos Aires, qui a présidé un temps l’IAS, les a listés : stigmatisation associée à la prise de médicaments, surtout pour les jeunes qui parfois se cachent, dans leur famille ou à leur travail, pour prendre leurs médicaments, ont peur d’être découverts (séropositif) ! Parfois, difficulté à avaler les grosses pilules ! Impact psychologique lié à la prise quotidienne (angoisse de savoir si on les a pris ou pas) et d’avoir une maladie incurable, à traiter à vie, risques de sauter des prises, difficultés de maintenir les prises en voyage, en week-end, arrêt des traitements pour n’importe quelle raison (opération chirurgicale, rupture d’approvisionnement…), tant de raisons qui font sourire quand on a connu les années d’avant les trithérapies, mais qui sont la source de mauvaise adhérence au traitement et finalement d’échec. 43,1% des patients interrogés (N=2 389), mettent en première ou deuxième priorité d’avoir accès à des traitements à longue durée de manière à ne pas être obligés de prendre des médicaments tous les jours.

Un autre sujet de préoccupation concerne les interactions entre les différents traitements, les problèmes d’absorption qui n’existent pas ou moins pour les formes injectables.

L’avenir de la trithérapie est la bithérapie

Pour Pedro Cahn, l’avenir de la trithérapie est plutôt la bithérapie, soit par voie orale, dolutégravir/3TC, dolutégravir/rilpivirine, soit sous forme injectable : cabotégravir/rilpivirine, doravirine/islatravir, lénacapavir/bictégravir, lénacapavir/islatravir, lénacapavir/b-Nabs, ….

Avec peut-être aussi des formes orales à prendre une fois par semaine ! Et, bien sûr pour toutes ces nouvelles spécialités, la question du prix et la mise à disposition dans les pays du Sud, qui relèvent de choix économiques et politiques.

Monica Ganda, directrice du service 86 de San Francisco, a présenté une revue des études cliniques. Pour la combinaison cabotégravir/rilpivirine (CAB/RPV), la plupart des études ont concerné des patients préalablement traités par ART orale. L’étude FLAIR chez les patients naïfs, mais traités préalablement par injectable et par une combinaison DGT/RPV/3TC per os pendant 20 semaines. L’étude ATLAS, CAB/RPV toutes les 4 semaines chez des patients indétectables depuis au moins 6 mois, ATLAS 2M pour une population identique, mais toutes les 8 semaines. L’étude CARES, CAB/RPV toutes les 8 semaines en Ouganda, Kenya et Afrique du Sud chez des patients sous ART oral. Avec, pour toutes les études, d’excellents résultats chez la plupart des patients et un taux d’échec virologique très bas lié à l’apparition d’une résistance dans 0,7 à 2,3% selon les études. Et Monica Gandhi de conclure : « You fail rarely but when you fail, you fail hard ! » Une autre étude (IMPAACT 2017/MOCHA chez des adolescents aux États-Unis, Ouganda, Botswana et Afrique du Sud et Thaïlande (N=140) n’a retrouvé, elle, aucun échec virologique et 100% de suppression de la charge virale.

Des switchs positifs

Monica Gandhi a aussi présenté une étude toujours en cours dans son centre à San Francisco au sein d’une population de 370 personnes séropositives pus ou moins marginalisées (46% d’usagers de drogues, 40% sans domicile stable), un tiers avait une charge virale >50 copies/ml. Après le switch, les patients étaient vus au centre deux fois/semaine. À la 48^e semaine, 99,4% de ceux qui ont commencé avec une charge virale indétectable étaient toujours virologiquement contrôlés, mais 97,9% de ceux qui avaient une charge virale détectable au début de l’étude étaient contrôlés (différence non significative entre les deux groupes).

Dans une méta-analyse parue dans le CID en décembre 2024, sur 32 études (N=9 224) avec le cabotégravir injectable, 1% d’échec virologique est retrouvé dans les études où les patients avaient une charge virale indétectable au moment du switch, et 5% quand le switch est fait alors que la charge virale est détectable.

Les guidelines de l’IAS-USA et du ministère de la Santé américain (DHHS) ont été modifiées en 2024 pour recommander l’utilisation des long acting (CABO/RPV) chez les patients qui ont une virémie persistante sous traitement oral malgré un «support intensif», après une décision commune du patient et du médecin, en étant conscient du risque de résistance qui limite les choix de traitement ultérieur et qui peut occasionner des contaminations.

Autres ART injectables

Le lénacapavir (LEN) est l’autre antirétroviral injectable disponible, un inhibiteur de capside qui agit à plusieurs niveaux de la réplication, extrêmement puissant, qui peut être administré en sous-cutané toutes les 26 semaines. Des essais pour le traitement sont en cours, qui associent LEN 2 fois/an et CABO toutes les 8 semaines (étude CAPELLA), un nouvel exemple de collaboration à saluer entre deux industriels.

D’autres associations sont prometteuses, Islatravir (inhibiteur de la reverse transcriptase 2mg/lénacapavir (capside inhibiteur) 300 mg par voie orale une fois/semaine qui va passer en phase 3.

En prévention (PrEP), le cabotégravir injectable (600 mg IM) toutes les 8 semaines est 66% plus efficace à 3 ans que l’association orale ténofovir/FTC dans une étude chez les HSH et transgenres (N=4566) (Landovitz. NEJM 2021)

Enfin, le lénacapavir injectable deux fois/an (N=2134) en prévention se montre plus efficace que l’association F/TAF (N=2136) ou F/TDF (N=1068) dans l’étude PURPOSE 1 chez des jeunes femmes (16-18 ans) en Afrique du Sud et Ouganda. Durée médiane de 52 semaines. Zéro contamination dans le bras LEN, 39 dans le bras F/TAF (2.02%), 16 dans le bras F/TDF (1.69%). L’étude PURPOSE 2 chez des hommes et Transgenre (Kelly NEJM 2024) donne des résultats similaires.

Session Long acting, ESCMID 2025

Quand on sait, comme le rappelle Monica Gandhi, qu’il y a plus de 40 millions de personnes vivant avec le VIH dans le monde, 1,3 million de nouvelles infections en 2024 (inchangé par rapport à 2022), 630 000 morts/an (comme en 2022) et seulement 77% sous ART (et 72% virologiquement contrôlés), disposer de nouveaux traitements plus efficaces, particulièrement en prévention apparait comme une arme supplémentaire pour parvenir aux objectifs 95.95.95 en 2030, malgré l’incertitude sur les financements dans ces temps mouvementés.

Session Long acting, ESCMID 2025

15 avril 2025

Actualités autour de la résistance aux antibiotiques

La lutte contre la résistance aux antibiotiques n’a pas encore dit son dernier mot. Florilège avec le Dr Florent Rossi (AP-HP Tenon, Paris) assidu à Vienne.

Par Florent Rossi, Hôpital Tenon, Paris

Antibiotiques Conférence ESCMID IST Recherche

L’OMS a présenté au cours de ce congrès ses données sur l’évolution de l’antibiorésistance dans le monde sur la période 2018-2022 (Tosas Auget et al., abstract E0498). Au global, la prévalence de S. aureus résistant à la méticilline et de E. coli résistant aux céphalosporines de 3^e génération dans les bactériémies était de 37,5% et 23,8%, respectivement. Ces tendances apparaissent comme stables comparé aux années précédentes. À noter également une augmentation de près de 70% de la prévalence globale des bactériémies à K. pneumoniae productrice de carbapénémase entre 2018 et 2022. [les carbapénémases sont des enzymes que produisent les entérobactéries et qui inactivent les carbapénèmes, dernière génération des antibiotiques de la classe des β-lactamines]. Les pays du Sud portent toujours le plus lourd fardeau, notamment dans le sous-continent indien et en Afrique centrale.

Cette association entre précarité et antibiorésistance s’étend jusque dans nos contrées. Plus proche de nous, une équipe nantaise s’est en effet intéressée aux facteurs sociodémographiques associés à la survenue d’infections urinaires communautaires à E. coli BLSE (Prime et al., abstract E0433) en croisant la base de données PRIMO avec les conditions de vie, l’état de santé et les données démographiques récupérés auprès de l’Insee et de l’assurance maladie. Les données ont été analysées à l’échelle des intercommunalités. Parmi les variables analysées, le nombre d’enfants de moins de cinq ans vivant au sein du foyer (IRR = 1.08 [1.04 – 1.13), ou le caractère surpeuplé du logement (IRR = 1.02 [1.01 – 1.22]) étaient associées à la survenue d’infections urinaire communautaires à E. coli BLSE.

L’IA prédictive

Face à ce constat, la lutte contre l’antibiorésistance s’appuie dorénavant sur les nouvelles avancées en termes de détection et de surveillance de ces pathogènes. Deux équipes ont par exemple présenté leur modèle de machine learning, qui fait appel aux réseaux de neurones pour permettre à un programme ou à un système informatique de développer ses performances de manière autonome, afin d’optimiser et de prédire la résistance de certaines souches bactériennes aux antibiotiques. C’est ainsi qu’une équipe chinoise a utilisé le séquençage génome complet (whole genome sequencing, WGS) pour construire un modèle de machine learning dans le but de prédire la résistance de souches de K. pneumoniae à 11 antibiotiques dont les carbapénèmes.

Ce modèle a pu prédire, avec une précision pouvant atteindre 90%, les souches non sensibles ou présentant des mutations associées à la résistance antimicrobienne (Jia et al., abstract O0734). En France, l’équipe du CNR de la résistance antimicrobienne basée au CHU de Bicêtre a développé un modèle de machine learning basé sur les données de spectrométrie de masse (MALDI-TOF) afin d’identifier les souches de K. pneumoniae ST23, qui sont des souches de K. pneumoniae productrices de carbapénémases particulièrement virulentes. Les modèles obtenus ont affiché une performance allant jusqu’à 95% pour la détection de ces souches (Dorter et al., abstract O0736). Ces avancées prometteuses seront peut-être un jour employées en pratique clinique pour réduire le délai de détection des pathogènes résistants et adapter plus rapidement l’antibiothérapie proposée.

De nouvelles molécules

Mais la lutte contre l’antibiorésistance passera aussi par le développement de nouvelles molécules et de nouvelles voies pour vaincre les infections les plus difficiles à traiter. Une équipe de l’Université d’Exeter au Royaume-Uni a par exemple présenté l’utilisation d’un traitement basé sur l’édition du génome à l’aide de CRISPR-Cas9 pour lutter contre des souches de E. coli BLSE. Ces « ciseaux moléculaires » entrainent la mort de la bactérie par l’édition du gène blaCTX-M-15. Ce modèle s’est avéré efficace pour détruire 99% des souches exposées, même si des facteurs d’échappement ont été identifiés (Morros-Bernaus et al, abstract L0011).

Les Viennois, hôtes de cette 35^e ESCMID Global, ont de leur côté identifié une nouvelle molécule appelée NQNO, un métabolite secondaire de Pseudomonas aeruginosa qui s’est avéré efficace in vitro contre des souches de N. gonorrhae multi-résistantes, tout en gardant un spectre particulièrement étroit puisqu’elle n’a pas montré d’activité contre les souches commensales de Neisseria et les lactobacilles de la flore vaginale (Nguyen et al., abstract L0012). Ces résultats sont encore préliminaires et le chemin sera encore long avant d’envisager une application dans la pratique clinique quotidienne, mais il est clair qu’en 2025 à Vienne, la lutte contre la résistance aux antibiotiques n’a pas encore dit son dernier mot.

15 avril 2025

Faut-il dépister systématiquement N. gonorrhoeae?

Environ 10 % des cas de Neisseria gonorrhoeae sont asymptomatiques selon la littérature, mais l’équipe du CHU d’Orléans estime qu’avec des charges bactériennes élevées, ces cas peuvent entraîner des transmissions. Alors, dépister et traiter ?

Par Guillaume Béraud, CHU d'Orléans

Dépistage ESCMID IST

L’équipe de Thierry Prazuck du CHU d’Orléans a exploré la corrélation entre la charge bactérienne de Neisseria gonorrhoeae au cours d’urétrite gonococcique et la présence ou l’absence de symptômes, à partir des valeurs de cycle threshold (Ct) obtenues par PCR L’urétrite à N. gonorrhoeae se manifeste classiquement par un écoulement purulent, mais environ 10 % des cas sont asymptomatiques selon la littérature. Cette recherche, menée à l’hôpital universitaire d’Orléans entre 2019 et 2024, a inclus 301 hommes testés positifs par PCR sur urine, répartis en trois groupes : symptomatiques avec écoulement, symptomatiques sans écoulement, et asymptomatiques.

Charge virale des patients asymptomatiques, Béraud et al. ESCMID 2025

Les résultats montrent que les valeurs de Ct, inversement proportionnelles à la charge bactérienne, sont significativement plus basses (donc avec une charge bactérienne plus élevée) chez les patients symptomatiques, qu’ils présentent un écoulement ou non, comparés aux asymptomatiques. Cette différence est observée avec deux types de test PCR (Roche et Seegene), bien que les valeurs absolues diffèrent selon la technique utilisée, d’où la nécessité d’éviter la comparaison entre les techniques. Parmi les participants, 21,6 % étaient asymptomatiques, un taux plus élevé que les estimations habituelles de la littérature, ce qui remet en question l’idée que la gonorrhée urétrale est presque toujours symptomatique

Charge bactérienne

L’étude révèle que les hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes (HSH) sont plus souvent symptomatiques, notamment avec écoulement, mais l’analyse multivariée montre que la charge bactérienne (valeurs Ct) dépend uniquement de la présence de symptômes et de la technique PCR, sans influence significative de l’âge, de l’orientation sexuelle, du nombre de partenaires ou des antécédents d’infection.

Ces résultats confirment les observations de deux études antérieures (Priest D et al, Sex Transm Infect 2017, Ratnappuli A et al Sex Transm Infect 2022), qui avaient un échantillon très limité, en démontrant que la charge bactérienne est plus élevée chez les symptomatiques. Cependant, la charge bactérienne chez les asymptomatiques, bien que plus faible, reste à un taux non négligeable, compatible avec une transmission potentielle. Cela n’élimine pas la possibilité que les infections asymptomatiques puissent contribuer à la propagation de la maladie, soulignant l’importance du dépistage systématique, notamment dans les populations à risque.

Limites et conclusion

Une limite majeure de l’étude est l’utilisation des valeurs Ct comme proxy indirect de la charge bactérienne, sans quantification absolue par qPCR standardisée ni prélèvements endo-urétraux, plus invasifs, mais plus précis. Néanmoins, le recours à la PCR sur urine reflète la pratique clinique courante. Des recherches futures combinant différentes méthodes d’échantillonnage et quantification pourraient affiner la compréhension de la relation entre charge bactérienne, symptômes et transmissibilité.

Par ailleurs, la littérature montre que la charge bactérienne varie selon le site d’infection, avec des charges plus élevées dans l’urètre que dans la gorge ou le rectum. L’étude s’inscrit dans ce cadre, confirmant que les patients symptomatiques ont des charges plus élevées que les asymptomatiques, ce qui pourrait influencer la probabilité d’infection et la dynamique de transmission.

Enfin, la différence observée entre les deux techniques PCR souligne la nécessité d’une standardisation des méthodes pour une meilleure comparabilité des résultats. Malgré des charges bactériennes plus faibles chez les asymptomatiques, celles-ci restent suffisantes pour envisager une infectiosité, justifiant ainsi le dépistage et le traitement précoce pour limiter la transmission.

En conclusion, cette étude met en lumière une association claire entre charge bactérienne et symptomatologie dans la gonorrhée urétrale masculine. Elle révèle un taux élevé d’infections asymptomatiques avec une charge bactérienne non négligeable, ce qui a des implications importantes pour la prévention et le contrôle de la maladie. Le dépistage élargi, notamment chez les populations à risque, et le traitement rapide des cas détectés sont essentiels pour réduire la transmission. Des recherches complémentaires sont nécessaires pour mieux comprendre les seuils de charge bactérienne associés à la transmissibilité et pour optimiser les stratégies diagnostiques et thérapeutiques.

15 avril 2025

Le fardeau des virus respiratoires chez l’adulte

Le fardeau des virus respiratoires chez l’adulte est principalement dû aux virus de la grippe, du Covid-19 et au virus respiratoire syncytial (VRS). Les données concernant le métapneumovirus humain (hMPV), virus à ARN appartenant à la même famille que le VRS, sont peu nombreuses. Lequel de ces virus comporte plus de risques de complications ?

Par Paul Loubet, CHU de Nîmes

Conférence ESCMID Prévention VRS

L’objectif de cette étude était de comparer le profil et le devenir des patients hospitalisés pour une infection à hMPV, VRS ou virus de la grippe, dans 5 CHU français entre 2012 et 2022.

Il s’agissait d’une analyse post-hoc de l’étude FLUVAC créée initialement pour évaluer l’efficacité des vaccins antigrippaux. Tous les patients, pour lesquels le résultat de la recherche des virus respiratoires par PCR multiplex sur écouvillon nasopharyngé étaient disponibles, ont été inclus.

Au total, 143 patients cas d’hMPV, 216 de VRS et 1453 de grippe ont été comparés. Les patients hMPV+ étaient plus âgés que les patients grippe + (78 vs 71) et plus vaccinés contre la grippe. La fréquence des comorbidités, équivalente entre les groupes, était élevée (80%). Les patients hMPV+ avaient plus souvent une pathologie cardiaque chronique que les patients grippe +.

Les patients hMPV+ ont eu plus de complications au cours de leur hospitalisation que les patients grippe + (60% vs 50%) principalement des décompensations cardiaques (22% vs 11%). Les complications des patients hMPV+ et VRS+ étaient similaires. La mortalité intra-hospitalière était équivalente entre les groupes (4%).

Résultats des patients hMPV+ vs grippe + selon le statut vaccinal contre la grippe, Loubet, ESCMID 2025

Lorsque la comparaison des patients hMPV+ et grippe+ était restreinte aux patients vaccinés contre la grippe, la survenue de complications était équivalente, soulignant le bénéfice du vaccin sur la réduction des complications même en cas d’infection malgré la vaccination.

La principale limite de cette étude était la période d’inclusion qui correspondait à la circulation du virus de la grippe, ce qui sous-estime la prévalence du hMPV étant donné que leurs circulations ne sont pas exactement superposables.

En conclusion, le hMPV est responsable d’hospitalisation chez l’adulte âgé et porteur de comorbidité et entraine fréquemment des complications, notamment cardiovasculaires, dans les mêmes proportions que le VRS ou la grippe. Des vaccins combinés VRS/hMPV sont en cours de développement et pourront peut-être, dans le futur élargir les options de prévention du fardeau des virus respiratoires chez l’adulte.

14 avril 2025

Les défis de la prise en charge des IST dues à chlamydia trachomatis

Pendant le symposium “STIs: an ongoing crisis » présenté à l’ESCMID Global 2025, Cécile Bébéar, directrice du CNR des IST bactériennes en France et présidente de l’action coordonnée IST à l’ANRS-MIE a présenté les challenges liés aux IST dues à Chlamydia trachomatis.

Par la rédaction de vih.org

Dépistage IST PrEP Prévention

C’est d’abord un défi épidémiologique, comme le montre la récente publication du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) en 2025 à propos des cas d’infections à chlamydia en Europe. Un total de 230 199 cas confirmés de chlamydia est rapporté dans 27 pays de l’Union européenne. Après une augmentation importante du nombre de cas en 2022, une légère baisse est observée en 2023, quel que soit le genre.

European Centre for Disease Prevention and Control. Chlamydia, Gonorrhoea, Syphilis. In: ECDC. Annual Epidemiological Report for 2023. Stockholm: ECDC; 2025.

Sur le plan diagnostique, les challenges concernent les tests rapides de type point of care (POCT) et les tests de viabilité. Plusieurs POCT basés sur des méthodes d’amplification d’acides nucléiques (TAAN) sortent sur le marché avec de bonnes performances analytiques et un rendu de résultat en moins de 30 minutes. Reste à savoir comment les positionner dans le soin primaire, hors les murs et «à la maison». Des tests de viabilité «maison» sont également publiés et évalués, pour la plupart chez les femmes. Ils permettent d’évaluer la valeur diagnostique des TAAN, qui comprennent des acides nucléiques de bactéries viables et non viables.

Une récente métanalyse publiée par Wong et al. dans Clinical Infectious Diseases en 2024 montre que 15%, 17% et 33% des échantillons vaginaux, cervicaux et anaux contiennent des chlamydiae non viables et donc non transmissibles. Ces tests pourraient guider les cliniciens pour décider ou non de traiter les patient.e.s asymptomatiques positifs à chlamydia et soumis.e.s à de nombreux dépistages itératifs. Reste à savoir comment les implémenter dans les chaines de diagnostic actuelles et dans la prise en charge des patient.e.s…

Un autre challenge concerne le dépistage des infections à chlamydia chez les populations clefs asymptomatiques. Plusieurs essais cliniques randomisés (RCT) ont montré que le screening intensif de chlamydia n’a pas d’effet sur la prévalence de cette IST en population générale. Cécile Bébéar cite l’exemple de l’étude Gonoscreen publiée en 2024 par Vanbaelen et al. dans Lancet HIV. Les auteurs n’ont pas montré de différence dans l’incidence des infections à chlamydia et à gonocoque chez les HSH utilisant la PrEP dans les deux bras de l’étude, un bras sans dépistage et un bras dépistant les deux IST tous les trois mois dans trois sites anatomiques. En conséquence, les guidelines belges sur l’usage de la PrEP en 2024 ne recommandent plus le dépistage systématique des IST à chlamydia et gonocoque chez les HSH asymptomatiques utilisant la PrEP.

Cécile Bébéar a présenté les dernières recommandations européennes sur la prise en charge des IST à chlamydia publiées en 2025 par March et al. dans Int. J STD AIDS. La doxycycline 200 mg par jour pendant 7 jours est clairement indiquée en 1ʳᵉ intention et préférée à l’azithromycine 1g DU. En effet, l’azithromycine en dose unique stérilise moins bien les infections rectales dans les deux sexes, particulièrement chez les femmes, comme l’a montré le RCT «Chlazydoxy » conduit dans l’équipe de Cécile Bébéar en 2022 (Peuchant et al. Lancet Infect Dis 2022). De plus, l’azithromycine DU a sélectionné de nombreuses résistances chez Mycoplasma genitalium, IST pour laquelle les macrolides sont le traitement de 1ʳᵉ intention.

Dépister ou ne pas dépister ? Cécile Bébéar, ESCMID Global 2025

Cécile Bébéar a terminé en présentant les essais cliniques utilisant la doxycycline en prévention des IST chez les HSH sous PrEP (DoxyPEP). Elle a notamment montré qu’aucune résistance acquise à la doxycycline n’a été décrite chez les patients infectés par chlamydia dans le RCT français DoxyVAC (Molina et al, Lancet Infect Dis 2024). Des inquiétudes persistant néanmoins sur les risques liés à une future implémentation de cette DoxyPEP, en raison du risque de sélection d’antibiorésistance sur les bactéries responsables d’IST, mais aussi sur des pathogènes présents dans les microbiotes digestifs et cutanéo-muqueux.

La femme enceinte face aux maladies infectieuses et à la vaccination

« Ce n’est pas toujours simple d’être une femme ». Derrière cet euphémisme, une session de posters discutés et commentés consacrés à la santé de la femme en infectiologie, et notamment de la femme enceinte.

Par Florent Rossi, Hôpital Tenon, Paris

Conférence Covid long Femmes Recherche Vaccin prophylactique

Deux études ont été présentées, s’intéressant aux infections respiratoires dans la population des femmes enceintes. Une première étude chinoise (Zhang et al., abstract E0358) s’est intéressée aux complications obstétricales chez les femmes infectées par le virus de la grippe au cours de leur grossesse, sur une période de sept ans (2012-2019) en comparant de manière rétrospective 394 infections à plus de 21 000 femmes vaccinées.

Si au global, il n’y avait pas de différence en termes de complications entre les femmes infectées et vaccinées (figure 1), les auteurs ont toutefois observé une augmentation significative du risque de petit poids à la naissance (OR = 1.70 [1.01-2.86]) et de prématurité (OR = 1.91 [1.18-3.09]) lorsque l’infection survenait au premier trimestre. A contrario, la vaccination était associée à une diminution significative du risque de césarienne (OR = 0.94 [0.90 – 0.98]) ou encore de prématurité (OR = 0.69[0.64 – 0.74].

Cette étude confirme toute l’importance de vacciner les femmes enceintes contre la grippe et ce, dès le premier trimestre. Situation complexe tant la liste de vaccins proposés à la femme enceinte est longue ¹ (outre le vaccin grippal, le vaccin contre le covid-19 la vaccination contre la coqueluche avec un vaccin tétravalent (dTcaP), la vaccination contre le VRS…) dans un contexte d’acceptabilité vaccinale complexe². En France, la couverture vaccinale contre la grippe chez la femme enceinte était estimée à 21% entre 2019 et 2021, loin encore de l’objectif de 75% de couverture vaccinale dans cette population (Vaux S et al, BEH 2023).

Fig. 1, comparaison des complications obstétricales chez les femmes infectées par la grippe ou vaccinées au cours de leur grossesse (Zhang et al., abstract E0358)

Femmes enceintes et covid long

Une seconde étude menée à Singapour (Tan et al., abstract E0360) a analysé de manière rétrospective une cohorte de 11 200 femmes infectées par le SARS-CoV-2 pendant leur grossesse (et dont plus de 99% avaient un schéma vaccinal complet) comparé à 15 200 femmes enceintes n’ayant pas contracté le virus et à 332 000 ayant été infectées en dehors d’une période de grossesse. Les femmes infectées enceintes avaient ainsi un risque significativement plus élevé de présenter des symptômes liés à l’infection en post-aigu (aHR = 13.39 [10.55-16.98]). Les principales manifestations observées étaient d’ordre neurologique. De façon intéressante, le risque de développer un covid long était accru au cours du 3^e trimestre de grossesse (aHR = 4.16[2.38 – 7.30]).

Ce sur-risque était mis en évidence quel que soit l’âge de la femme au moment de sa grossesse, et donc indépendamment du seuil des 35 ans au-delà duquel une grossesse est dite « gériatrique » par les spécialistes de la question. Si les conséquences à long terme de l’infection par le SARS-CoV-2 sont maintenant bien connues et décrites, cette étude a l’intérêt de s’intéresser spécifiquement à la population particulière des femmes enceintes à l’ère d’Omicron.

13 avril 2025

Les apports de la métagénomique en infectiologie pour la clinique, au cœur de l’ESCMID 2025

Parmi la pléthore de sessions proposées au cours de cette 35ème session de l’ESCMID Global, les avancées dans le domaine du diagnostic microbiologique des infections ne sont pas oubliées, avec notamment une session sur le rôle de la métagénomique en pratique clinique.

Par Florent Rossi, Hôpital Tenon, Paris

Conférence mondiale ESCMID Infectiologie Métagénomique

La métagénomique permet l’étude de l’ensemble du matériel génétique présent au sein d’un échantillon à l’aide de techniques de séquençage haut débit (mNGS). Ce matériel est ensuite comparé à une base de données afin d’identifier les micro-organismes d’intérêt, par exemple pathogènes, au sein d’un échantillon. L’idée est de permettre de faire un diagnostic microbiologique là où les techniques conventionnelles (cultures standards, PCR…) sont prises en défaut. C’est actuellement l’outil diagnostique le plus puissant qui permet aussi de retrouver des agents infectieux oubliés ou nouveaux. Les méthodes conventionnelles de microbiologie incluent les examens macroscopiques et microscopiques, la culture pour les micro-organismes cultivables, les sérologies, les PCR (polymerase chain reaction) spécifiques ou multiplexes syndromiques, et le séquençage des zones conservées de bactéries (technique 16 S) et des champignons (ITS). Ces méthodes ne permettent pas toujours l’identification d’un micro-organisme lors d’une infection. Sans la métagénomique, de nombreuses infections restent sans agent identifié. C’est le cas par exemple d’environ 50 % des méningites ou des encéphalites. En effet, l’utilisation des méthodes conventionnelles peut être limitée par une faible charge microbienne dans le prélèvement, l’administration précoce d’un traitement probabiliste, ou un délai de pousse prolongé.

Apport dans le diagnostic et dans la thérapeutique

D’abord un travail montrant l’apport du NGS dans le diagnostic d’une bactériémie. L’étude de Nielsen et al. (abstract O0011) a comparé de manière prospective (n = 186) l’utilisation du NGS à cet effet, comparé aux techniques conventionnelles (ie. les hémocultures) chez des patients admis aux urgences d’un hôpital danois pour suspicion de bactériémie. Ainsi, tous les résultats positifs en hémocultures ont été positifs en NGS. Mais l’analyse NGS a également permis d’identifier des bactériémies cliniquement significatives chez 12/186 (6,5%) des patients chez qui la suspicion de bactériémie était forte et pour lesquels les hémocultures s’étaient révélées négatives.

Un travail allemand par Schroeder et al (abstract O0014) s’est intéressé au rôle du NGS pour obtenir une documentation microbiologique, et a analysé de manière rétrospective 875 résultats de NGS obtenus en réanimation, cette fois. L’analyse NGS était positive dans 56% des cas, tandis que les hémocultures n’étaient positives que dans 16% des cas. Les micro-organismes identifiés en NGS se partageaient entre bactéries (78.5%), virus (19.5%) et champignons (2.1%). Ces identifications supplémentaires auraient pu permettre, après revue rétrospective des dossiers, une adaptation de l’antibiothérapie dans 40% des cas.

Il faut noter qu’au sein des travaux proposés, le clinicien avait accès aux résultats du NGS relativement rapidement (quelques jours, voire le jour-même). Il faut mettre cela en perspective avec la disponibilité au sein de nos centres en France, où le diagnostic métagénomique peut prendre plusieurs semaines à être obtenu, conduisant finalement à l’obtention d’un diagnostic rétrospectif, sans impact sur l’antibiothérapie à la phase aiguë.

Faire lien entre microbiote vaginal et persistance de HPV

Au-delà de l’aspect diagnostique, le NGS pourrait avoir un intérêt pour faire lien entre microbiote vaginal et persistance de HPV chez la femme. Ainsi, une étude chinoise a analysé 640 échantillons issus de prélèvements vaginaux (Qi et al., abstract O0018) parmi 4572 femmes en bonne santé ont été analysés en métagénomique NGS et en NGS ciblé (tNGS). Il en résulte une différence significative de la population bactérienne parmi les femmes HPV-négatives, positives à haut-risque et positives à bas risque. Ainsi, une proportion importante de Lactobacillus au sein de la flore vaginale était associée aux HPV à haut risque, tandis que Gardenella vaginalis était associé aux HPV à bas risque. De la même façon, un ensemble associant Streptococcus agalactiae, Bacteroides xylanisolvens et Klebsiella aerogenes était associé à une clairance plus importante d’HPV.

Le mNGS confirme donc son statut d’élément prometteur pour le clinicien, tant pour les aspects diagnostiques que thérapeutiques, voire pronostiques dans la prise en charge des patients en maladies infectieuses.

13 avril 2025

L’infodémiologie: une présence plus que timide à l’ESCMID 2025

Le thème de infodémie fait (trop) doucement son chemin dans les conférences scientifiques de clinique ou de sciences fondamentales en infectiologie telles que l’ESCMID. Même chose pour l’infodémiologie, la science de la gestion des infodémies.

Par Gilles Pialoux, vih.org

Conférence mondiale ESCMID Infectiologie Infodémie

L’Organisation mondiale de la santé (OMS) défini l’infodémie comme une surabondance d’informations, exactes ou non, dans l’espace numérique et physique, accompagnant un événement sanitaire aigu tel qu’une flambée ou une épidémie. Elle peut avoir un impact sur la perception des risques, la confiance dans le système de santé et les professionnels de la santé.

L’analyse des composants de la désinformation, des fake news, du complotisme sanitaire et l’évaluation de leur impact sur les politiques publiques de prévention et de réponse aux pandémies apparait pourtant comme essentielle pour la communauté scientifique, afin de déterminer la riposte qu’elle se doit d’y apporter.

Une récente revue générale sur le sujet atteste que les infodémies ont un impact délétère sur la santé physique et mentale, affectant les dimensions sociales et politiques comme l’antivaX ou le rejet des politiques publiques¹.

La session dédiée intitulée «How to address anti-science in our community?» n’a pas vraiment tenu ses promesses. Malgré Tyra Grove Krause (Staten Serum Institut, Danemark) qui a rappelé en introduction qu’il s’agissait d’«un sujet particulièrement d’actualité à l’heure de la désinformation notamment vis-à-vis du vaccin contre la rougeole». Sans en dire plus. A ce titre, la session était assez décevante au regard de l’importance du sujet et du nombre d’équipes dans le monde —notamment en France²— qui travaillent en science de l’information sur l’infodémie, particulièrement celle qui passe par les réseaux sociaux.

Une projection-débat pour illustrer l’infodémie

La surprise est venue d’une session inattendue de « movie » dédiée à la projection-débat du film Contagion, ce thriller d’anticipation américain réalisé par Steven Soderbergh, sorti en 2011; neuf ans après l’émergence du SRAS (800 morts) dont il reprend des éléments de réalité et huit ans avant le Sars-Cov-2 (7 090 776 de morts selon l’OMS au 23 février 2025), dont il anticipe à l’américaine certaines des retombées. Un film «très US centré» selon William Hanage (Boston, Etats-Unis), co-chair de la session. On y voit entre autres Gwyneth Paltrow mimer parfaitement la convulsion, un complotiste Alan Krudwiede (joué par Jude Law) en campagne de désinformation à partir de la vidéo d’un homme s’effondrant dans le métro hongkongais et le docteur Erin Mears (Kate Winslet) nous expliquer l’importance du taux de reproduction (R0). Sièges de congrès, questionnaire papier et des pop corn pour la salle (trop de bruit de papier) et Martini (vrai ?) pour les chairmen. Une ambiance de salle de cinéma d’art et d’essais assez rare dans un congrès mondial.

La projection était entrecoupée par deux fois d’un débat avec la salle (d’abord à la 35eme minute du film) autour de questions centrales que pose en filigrane ce film prémonitoire de la crise sanitaire :

«Basé sur ce que vous venez de voir, pouvez-vous prédire ce qui va arriver?»
«Quelles stratégies de contrôle sanitaire mettriez-vous en place à ce stade?»
«Quels exemples vous semblent similaires?»
«Est-ce que le R0 permet de comprendre un potentiel épidémique?»

Puis au bout d’une heure et dix minutes de film :

«À quel challenge sont confrontés les scientifiques pour développer un vaccin sous la pression?»
«Comment la désinformation impacte-t-elle les efforts de santé publique? etc.»

Iconoclaste et intéressant débat.

Revenons à la courte session orale qui précéda la session «movie» sur le thème «How to address anti-science in our community»: les deux communications orales ont surtout tourné autour d’une réflexion sur la «vérité» en science qui est un sujet dans le sujet. Selon une étude danoise, 19% des personnes considèrent que les scientifiques ne doivent pas communiquer avec les politiques. A aussi été évoqué le poids différentiel des religions dans l’infodémie identifié dans la plupart des études ou sondages et la corrélation inverse entre equality et truth. On a regretté une focalisation sur le Covid alors que la question du confinement qui a fait perdre la confiance envers le politique et le scientifique demeure exportable à d’autres agents infectieux comme on l’a vu récemment pour le pseudo «nouveau virus chinois» —en l’occurrence le metapneumovirus—, ou le Mpox. Au-delà des concepts mobilisés avec peu d’études citées sur les fake news circulant sur les réseaux sociaux, on retiendra le baromètre «Eurobaromètre 2024» qui établit que 80% des personnes interrogées considèrent que les recherches publiques devraient être disponibles online et en libre accès et 77% qui déclarent que la science et la technologie devraient mieux considérer les besoins des personnes dans la recherche et le développement des molécules ou des stratégies préventives. Une position citoyenne qui donne l’impression que la recherche ne traite pas des questions qui sont importantes pour eux, ce qui représenterait une critique sérieuse – et sans doute en grande partie infondée de la science.

Quelques recettes ont été distillées par l’oratrice danoise quant à la manière d’aborder l’anti-science :

«Prenez le problème au sérieux, ne pensez pas qu’il ne vous concerne pas.»
«Critiquez la qualité de la recherche»
«Abordez la culture universitaire en vérifiant les sources»
«Prenez des mesures contre les acteurs malveillants affiliés à des universités»
«Prenez les préoccupations des citoyens au sérieux»
«Méfiez-vous des tactiques politiques populistes (et demandez conseil!)»

Gageons que les organisateurs des prochaines conférences nationales ou internationales (JNI, EACS, IAS, AFRAVIH…) seront mieux inspirés. A l’heure des réseaux sociaux, de l’IA et des algorithmes, on peut craindre que ces recommandations soient peu efficaces !

12 avril 2025

Première vedette de l’ESCMID 2025: le VRS

Le VRS (virus respiratoire syncytial) est l’une des vedettes indiscutables de l’ESCMID 2025, comme en atteste le nombre de sessions qui lui sont consacrées dans l’immense Messe Wien Center où, contrairement au programme, tout est bien organisé. Et comme en atteste également le nombre de laboratoires pharmaceutiques mobilisés contre lui.

Par Gilles Pialoux, vih.org

Conférence mondiale ESCMID Infectiologie VRS

Dire que le Messe Wien Center est un centre de congrès avec de l’espace est un euphémisme, tant le centre des congrès, à quelques foulées du Danube, est gigantesque, avec ses espaces de convivialité, d’échanges et ceux dédiés aux laboratoires pharmaceutiques. On peut même s’y faire photographier avec accessoires festifs sur fond de l’opéra national de Vienne (document non fourni). À vue de nez, on doit frôler les 10000 congressistes. Le Congrès européen est devenu mondial et a pris de l’embonpoint avec la crise covid et la fin de la trop américaine Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC). Trump II va sans doute renforcer la présence américaine qui y est déjà importante.

Le VRS est l’un des virus respiratoires saisonniers – avec la grippe, le métapneumovirus, le SARS-CoV-2— qui pèse le plus sur le système de soins. Chez le nourrisson, mais aussi chez l’adulte. Dans 60 à 90% des cas de bronchiolite chez le nourrisson, l’agent infectieux responsable est le VRS. Chaque année, près de 30% des enfants de moins de 2 ans contractaient une bronchiolite, soit environ 480 000 cas par an. Et 2 à 3% des nourrissons de moins de un an sont hospitalisés pour une bronchiolite plus sévère.

Chez les personnes plus âgées, le VRS peut induire des complications respiratoires graves (syndrome de détresse respiratoire aiguë, exacerbation d’une maladie chronique cardiopulmonaire ou pneumopathie nécessitant une assistance respiratoire en réanimation) susceptibles de conduire au décès. Chaque hiver, ce sont 15 000 à 20 000 personnes âgées qui sont hospitalisées en France à cause du VRS et plusieurs milliers en meurent.

Dans l’attente d’antiviraux (cf. infra), deux stratégies visant à limiter les effets dévastateurs du VRS sont mises en place durant la saison de circulation du VRS: l’immunisation par un anticorps monoclonal (ACMC, nirsévimab/BEFORTUS pour l’heure) ou la vaccination (deux vaccins ont obtenu leur AMM européenne, AREXVY de GSK – remboursé dans les indications de la HAS – et ABRYSVO de Pfizer – non encore remboursé – en attendant le vaccin ARNm de Moderna en approche). Pour l’enfant à naître, ces deux stratégies sont possibles : la vaccination des mères pendant la grossesse ou l’immunisation par anticorps monoclonaux des nouveau-nés et des nourrissons. Cette alternative sans précédent en maladies infectieuses est laissée au choix des parents. Ce qui nécessite des efforts de pédagogie. Pour l’adulte, la HAS a en juillet 2024 déterminé la population cible en dehors de la femme enceinte : les personnes de 75 ans et plus et celles de plus de 65 ans présentant des pathologies respiratoires ou cardiaques chroniques.

Epidémiologie européenne du VRS

Pour se convaincre de l’intérêt global envers ce virus respiratoire à l’ESCMID 2025, il fallait être à la session EW 041 Hall 13 à 8h30, premier jour du congrès proprement dit, qui était full. Eeva Broberg (ECDC, WO 128) a dressé une vue de l’épidémiologie européenne 2020-2025 du VRS et du fardeau de cette infection en Europe: 245 244 admissions par an d’enfants de moins de 5 ans, 1,8% des enfants européens sans facteur de risque (prématurité, immunodéficience, trisomie 21) seront hospitalisés la première année de vie, 3 049 039 cas chez les plus de 60 ans (sous-estimés) et 19 527 décès à l’hôpital dans cette tranche d’âge. Avec des données actualisées à la semaine 13 de 2025 : 7% de positivité dans 20 pays. Les courbes comparées des hivers – le pic de VRS se situe entre Noël et jour de l’an – démontre un retour à l’ère pré-pandémique tel qu’observée l’hiver 2020-2021 avec une co-circulation de la grippe et du covid-19 (Figure 1).

Figure 1 : Source : Santé publique France / Bulletin Infections respiratoires aiguës / Semaine 14 /
Édition nationale / Publication : 9 avril 2025 / p. 9

En matière d’ACMC, Louis Bont (WO 129 ; Utrecht, Pays-Bas) a révélé le pays de référence en matière de couverture préventive du VRS: le Chili. Son programme national d’immunisation par le nirsévimab a permis en 2024 une couverture de 83-98% des enfants de moins de 4 ans, la distribution de 93 373 doses se traduisant par une réduction de 86% des admissions en soins intensifs et de 75% d’hospitalisations avec zéro décès versus 13 en 2023! Ce pédiatre a aussi décliné les possibles ACMC de seconde génération: clesrovimab (MK 1654), un long acting prometteur de Merck et le suptavumab (REGN2222), serpent de mer en phase III, ainsi que la poussée des antiviraux directs qui viendraient refermer l’étau contre le VRS : Ziresovir (ArkBio) en phase III, avec de bons résultats, Sisunatovir (Pfizer) « programme terminé » selon la présentation orale et Zelicapavir (Enanta) en phase II. La couverture immunisante en France par le nisevimab et les données socio-démographiques ont été récemment publiées¹ ainsi qu’une grande étude cas/contrôle de ses effets protecteurs, étude que l’on doit au groupe EPIPHARE². Ainsi que des recommandations HAS.

«Progrès dans l’efficacité des vaccins contre les infections respiratoires»

Même affluence Hall 9 à 11 h pour la session LB 001: «Advances in vaccine effectiveness for respiratory infections» avec Jean-Paul Stahl (France) comme co-chair. L’occasion d’abandonner un temps le VRS pour revenir sur les coronavirus, avec Frances Priddy (Cambridge, USA L 0001) et le développement des vaccins ARNm de Moderna contre les variants JN.1 et KP-2 du SARS-CoV-2. De bons résultats en termes d’immunogénicité neutralisante, mais la diminution des titres d’anticorps contre les sous-variants qui suivent, KP.3.1.1, XEC et LP 8.1, laisse encore entrevoir des capacités d’échappement de ces variants.

Daniel Jenkin (Oxford Vaccine Group, L0004) nous a emmenés vers le très oublié des coronavirus, le MERS responsable du syndrome respiratoire du Moyen-Orient, à forte mortalité, avec le développement d’un vaccin ChAdOx1 prometteur avec une bonne réponse immune. Même chez les personnes qui ont déjà été exposées au même vecteur (adénovirus) utilisé dans nombre de vaccins, dont celui contre le covid développé précisément par l’université d’Oxford. En espérant que la destinée de ce vaccin VRS soit meilleure que son équivalent contre le covid, notamment en termes de stabilité de la protéine vaccinale.

C’est dans ce contexte de triple réponse (ACMC, vaccin puis un jour antiviraux) que se pose la question centrale de la pression de sélection et de la sortie de variants du VRS résistant notamment à nirsévimab. Le nirsévimab cible en effet un site antigénique spécifique (l’épitope Ø) sur une protéine située à la surface du VRS impliquée dans la multiplication virale – la protéine de fusion F – et bloque ainsi le virus. Il existe un risque théorique d’émergence de variants du VRS portant des mutations de résistance à la neutralisation par le nirsévimab, même en absence de pression de sélection par l’anticorps. Le VRS est, en effet, comme tout virus à ARN, un virus variable et ce risque pourrait augmenter avec l’utilisation préventive généralisée du nirsévimab. Comme ce fut le cas pour le virus du covid.

L’étude POLYRES

C’est pour cela que la présentation orale du Pr Slim Fourati, responsable de l’unité de Virologie-virus respiratoires au CHU Henri Mondor, Inserm U955, s’est retrouvée dans le top 10 des communications orales du 12 avril. Travaux portant sur la «Caractérisation moléculaire des infections par le VRS chez les patients âgés au cours de la saison 2023/2024» et fruit d’une collaboration AP-HP Inserm, Université Paris-Est-Créteil (UPEC) Institut Pasteur et bénéficiant d’un financement de l’ANRS-MIE dans le cadre du consortium EMERGEN. L’étude POLYRES, c’est son nom, présente les caractéristiques du virus respiratoire syncytial après traitement par le nirsévimab dans une étude observationnelle se déroulant en vie réelle au cours de la saison hivernale 2023-2024 comme déjà publiée en octobre 2024 et prolongée pendant l’hiver 2024-2025. Lors des essais cliniques de phase IIb/III, seuls 48 VRS ayant infecté des enfants sous traitement par le nirsévimab avaient pu être étudiés et des mutations d’échappement avaient été retrouvées chez deux d’entre eux. Dans cette étude menée entre septembre 2023 et mars 2024, 695 nourrissons âgés de moins d’un an infectés par le VRS et provenant de 31 hôpitaux français ont été inclus: 346 cas recevant du nirsévimab et 349 cas non exposés.

Le séquençage du génome complet du VRS a révélé la co-circulation de plusieurs lignées de VRS-A et de VRS-B dans les infections non exposées au nirsévimab et dans les cas survenant chez les exposés. Le VRS-A était majoritaire cette saison et a été retrouvé chez 87% des enfants infectés (N=472) et le VRS-B dans 13 % des cas. Les équipes ont analysé les caractéristiques des VRS-A et VRS-B présents dans les prélèvements nasopharyngés réalisés dans le cadre de la prise en charge habituelle des enfants. La séquence complète du génome viral a été déterminée pour rechercher en particulier des mutations dans le site de liaison (le site Ø) du nirsévimab (analyse génotypique). La capacité du nirsévimab à inhiber la multiplication des virus en culture cellulaire a également été étudiée (analyse phénotypique). L’analyse de 472 VRS-A (dont la moitié provenant d’enfants traités) n’a révélé aucune mutation de résistance au nirsévimab dans le site Ø de la protéine F. Dans les cas survenus chez les enfants exposés (breakthrough), tous les isolats de VRS-A restent sensibles au nirsévimab. Pour le VRS-B, l’équipe a identifié deux variants (2/24) hautement résistants au nirsévimab : (i) porteurs d’une mutation de résistance F:N208D et d’un double mutation F:I64M + F:K65E jamais décrite. Les tests d’inhibition de la fusion ont permis d’identifier ces deux profils mutationnels dans le VRS-B induisant une résistance à l’inhibition de la fusion par le nirsévimab, ce qui suggère un niveau élevé de résistance au nirsévimab. L’équipe a identifié le mécanisme moléculaire (en 3D) de cette résistance très rare, mais posant question. Au cours de la saison 2024-2025, environ 800 nourrissons ont été recrutés. Le séquençage et l’analyse phénotypique sont en cours, a-t-il été précisé.

Cette étude reste la plus vaste concernant des analyses virologiques d’échecs au nirsévimab à ce jour. Pour Slim Fourati, «la faible prévalence des mutations de résistance au nirsévimab chez des patients traités est rassurante. Toutefois, quelques VRS-B issus de patients traités analysés à ce jour présentaient des mutations d’échappement, ce qui invite à la prudence et souligne l’importance d’une surveillance moléculaire active dans le contexte d’une future utilisation du nirsévimab à l’échelle mondiale».

11 avril 2025

Congrès de l’ESCMID 2025 à Vienne: la valse des infections (ré)émergentes

Du 11 au 15 avril 2025, la conférence de l’ESCMID rassemble à Vienne le gratin de l’infectiologie mondiale pour une journée dédiée à l’enseignement le 11, et 4 jours intenses de présentations (keynote, sessions scientifiques, open forums, symposiums, posters, etc.) dans 16 halls et 3 arènes de Messe à Vienne (Autriche)…

Par Gilles Pialoux, vih.org

Arbovirose Conférence Covid-19 IST One Health PrEP Recherche VIH

« Pour un avenir plus sain, nous devons lutter contre les infections en collaborant au-delà des frontières et des disciplines. » Robert Skov, président de l’ESCMID.

La dernière fois que nous étions à Vienne, à deux heures de Paris, c’était en 2010 (même si certains d’entre nous y étaient pour suivre la 62^e session de la Commission des stupéfiants de l’ONUDC). Vih.org s’appelait alors Transcriptases (cf. image) et nous couvrions, dans un numéro spécial d’un rouge de combat, la XIII^e conférence internationale sur le sida en partenariat avec l’ANRS ¹. Vingt-cinq ans après, l’ANRS est devenue l’ANRS-MIE pour Maladies infectieuses émergentes et c’est grâce à son soutien que vih.org couvre cette conférence de l’ESCMID ², ouverte à l’ensemble des maladies infectieuses. Une première pour notre petite équipe rédactionnelle qui suit la mue de notre site, débutée bien avant la crise sanitaire du covid vers les émergences et le concept de One Health.

Couverture du n° 144 de Transcriptases

Un congrès pléthorique

Plus de 8 000 experts en infectiologie sont en effet à Vienne du 12 au 15 avril, pour un congrès où les échanges porteront notamment sur la grippe aviaire, l’apport d’Internet et de l’IA à la prévention, la révolution de la métagénomique (EW078, 0S037), la recherche vaccinale contre les virus (ré)émergents (0S107, LB001), les arboviroses les retombées infectiologiques des migrations (EF040), les aspects éthiques de la lutte contre le VIH (F0050), le spectre des IST à l’heure de la PrEP et de la Pep par antibiotiques (SY067, EP111), le fardeau mouvant des infections respiratoires saisonnières (grippe, VRS, SARS-CoV-2, métapneumovirus…) (0S032, 0S046, JS1), etc. Des spécialistes venus du monde entier aborderont aussi la perte d’efficacité constatée dans plusieurs pays pour nombres d’antibiotiques, faisant de l’antibiorésistance l’un des challenges du One Health et la poussée dans le monde des infections nosocomiales. Il est même une session sur les risques infectieux des… WC (SY060) !

L’ESCMID produit aussi régulièrement des guidelines toujours très attendues, comme celles sur la prise en charge des encéphalites ou des endocardites. Impossible de tout couvrir, d’autant que le programme est particulièrement riche, à tel point qu’il est compliqué de naviguer dans l’e-book ou sur le site, avec une multitude de codes couleurs sans hiérarchisation ni datation accessible aisément. Le moteur de recherche et le Top 10 des communications orales est un atout. Permettant au passage de suivre la production française.

Les Frenchies et les autres

Ainsi dès samedi 12 avril, nous suivrons Slim Fourati (Virologie, Hôpital Henri Mondor, Créteil ³) qui se retrouve dans le Top 10 des communications orales de la journée (OS032) avec la « caractérisation virologique des infections à VRS (virus respiratoire syncytial) après la percée du nirsevimab dans une étude observationnelle multicentrique en situation réelle en France ». Le nirsevimab, cet anticorps monoclonal à longue durée d’action, a révolutionné la prévention des infections à VRS chez l’enfant (approuvé en 2023 par l’agence européenne du médicament et son équivalente américaine, la Food and Drug Administration) avec plus de 210 000 doses administrées au cours de l’hiver 2023/2024 chez des enfants âgés de moins d’un an en France.

On suivra le même jour Paul Loubet qui couvre le congrès pour nos amis de la Lettre de l’infectiologue (Maladies infectieuses, CHU de Nîmes) pour une communication orale sur les « caractéristiques de l’infection à métapneumovirus humain par rapport au virus respiratoire syncytial et aux infections grippales chez les adultes hospitalisés pour maladie grippale en France, 2012-2022 ». Et bien sûr, nous suivrons aussi des Italiens, des Allemands, des Anglais…. Avec cette question à la marge du programme: l’Europe de l’infectiologie répondra-t-elle sous une forme ou sous une autre à la menace trumpienne sur la santé globale ?

12 avril 2025

ESCMID Global: une affection respiratoire par VRS multiplie par près de trois le risque de décès chez l’adulte

Une étude nationale menée au Danemark révèle que les adultes atteints d’une infection respiratoire aiguë associée au virus respiratoire syncytial (IRA-VRS) présentent un risque de décès 2,7 fois plus élevé dans l’année que la population générale.

Par Christelle Destombes, Vih.org

Conférence ESCMID Infectiologie Recherche VRS

L’infection respiratoire aiguë par le VRS désigne un groupe de maladies causées par le virus respiratoire syncytial (VRS), un virus courant et très contagieux qui affecte principalement les voies respiratoires¹. Son impact sur les nourrissons et les jeunes enfants est bien documenté, mais il peut également entraîner de graves complications chez les adultes, notamment des pneumonies et des maladies respiratoires chroniques².

Malgré ces risques, l’ampleur de son impact chez les adultes reste mal connue. Cette étude de cohorte nationale danoise a analysé les données de 5 289 adultes (≥ 18 ans) diagnostiqués avec une infection respiratoire aiguë par le VRS entre 2011 et 2022, en les comparant à celles de 15 867 témoins issus de la population générale. Les résultats cliniques et économiques ont été évalués jusqu’à 365 jours après l’apparition de l’infection respiratoire aiguë par le VRS.

Décès, complications…

Outre le risque accru de décès, l’étude a révélé que les adultes atteints d’une infection respiratoire aiguë par le VRS présentaient des résultats de santé significativement moins bons. Au cours de la période de suivi de 365 jours, les exacerbations de BPCO et d’asthme étaient respectivement 3,1 et 4,6 fois plus fréquentes chez les patients atteints d’IRA-VRS. Il est donc crucial de porter une attention particulière aux patients présentant ces affections sous-jacentes afin de prévenir des complications potentiellement mortelles.

Les taux d’hospitalisation de ces patients étaient plus de deux fois supérieurs à ceux du groupe témoin (57 % contre 28 %), et les admissions en unité de soins intensifs étaient près de quatre fois plus élevées (5,3 % contre 1,4 %).

…et dépenses de santé

À ces impacts sanitaires s’ajoute l’impact économique de l’IRA-VRS: les coûts directs de soins pour les patients atteints d’IRA-VRS pendant la période de suivi de 365 jours s’élevait à 20 181 euros, soit plus du double des 8 085 euros dépensés en soins de santé pour les personnes du groupe témoin.

«L’un des résultats les plus marquants de cette étude est l’impact prolongé et significatif de l’IRA-VRS», a déclaré Maria João Fonseca, auteure principale de l’étude. Même après la phase aiguë, les patients ont continué à présenter des résultats moins bons que la population générale. Cela souligne la gravité et la persistance des effets des infections respiratoires aiguës à VRS.

Stanislava Bratković, co-auteure, a déclaré: «La vaccination s’est avérée très efficace pour prévenir les complications graves dues au VRS. Compte tenu du fardeau important des infections respiratoires aiguës à VRS mis en évidence par notre étude, il est essentiel de prioriser la vaccination des populations vulnérables afin de réduire les complications de santé et les coûts associés.»

Fonseca, M. J., Bratković, S., et al. (2025). Clinical and economic burden of respiratory
syncytial virus in adults with acute respiratory infections – a Danish nationwide cohort study.
Oral presentation. ESCMID Global 2025.

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