Quelle contribution des infections récentes à l’épidémie globale?
Actuellement, le débat scientifique quant à la contribution à l’épidémie de VIHVIH Virus de l’immunodéficience humaine. En anglais : HIV (Human Immunodeficiency Virus). Isolé en 1983 à l’institut pasteur de paris; découverte récemment (2008) récompensée par le prix Nobel de médecine décerné à Luc montagnier et à Françoise Barré-Sinoussi. des transmissions intervenant suite à une contamination récente est intense. L’infection récente est généralement définie comme la période de 2 à 6 mois faisant suite à la contamination. Cette période comprend la phase d’infection aiguë (période précédant le développement d’anticorps), qui est caractérisée par un pic dans la charge viraleCharge virale La charge virale plasmatique est le nombre de particules virales contenues dans un échantillon de sang ou autre contenant (salive, LCR, sperme..). Pour le VIH, la charge virale est utilisée comme marqueur afin de suivre la progression de la maladie et mesurer l’efficacité des traitements. Le niveau de charge virale, mais plus encore le taux de CD4, participent à la décision de traitement par les antirétroviraux. La fin de ce pic de charge virale marque l’entrée dans la phase chronique de l’infection.
Au haut niveau de charge viral atteint durant la phase aiguë correspond une forte augmentation de l’infectiosité des personnes VIH-positives. En outre, des études animales et des données épidémiologiques suggèrent que l’augmentation de la transmissibilité du VIH durant la phase aiguë serait plus importante que ce qui serait attendu sur la seule base de l’augmentation du niveau de charge virale1Ce phénomène pourrait être expliqué par la prédominance de souches virales plus infectieuses au moment de l’infection aiguë que pendant l’infection chronique, comme cela a été observé chez le macaque.
Ma Z-M, Stone M, Piatak M Jr, Schweighardt B, Haigwood NL, et al. (2009) High specific infectivity of plasma virus from the pre-ramp-up and ramp-up stages of acute simian immunodeficiency virus infection. J Virol 83: 3288–3297. doi:10.1128/JVI.02423-08.2Hollingsworth TD, Anderson RM, Fraser C (2008) HIV-1 transmission, by stage of infection. J Infect Dis 198: 687–693. doi:10.1086/590501.. Cette phase courte et difficile à capter par les stratégies existantes de dépistage du VIH est susceptible de conduire à des transmissions survenant avant le diagnostic et, dans un scénario de type Tester et Traiter, avant l’initiation des ARV.
Une revue de la littérature de 2011 a mis en lumière des estimations très différente de la proportion des transmissions survenant pendant cette période : de 8% à 75% de l’ensemble des transmissions selon les études3Cohen MS, Shaw GM, McMichael AJ, Haynes BF (2011) Acute HIV-1 Infection. N Engl J Med 364: 1943–1954. doi:10.1056/NEJMra1011874.. Les estimations de la durée de la période d’hyper-transmissibilité (le pic dans la charge virale) varient également largement : certains auteurs considèrent que cette période dure environ deux semaines quand d’autres l’estiment autour de 5 mois 4Cohen MS, Dye C, Fraser C, Miller WC, Powers KA, et al. (2012) HIV Treatment as Prevention: Debate and Commentary—Will Early Infection Compromise Treatment-as-Prevention Strategies? PLoS Med 9: e1001232. doi:10.1371/journal.pmed.1001232.5Powers KA, Ghani AC, Miller WC, Hoffman IF, Pettifor AE, et al. (2011) The role of acute and early HIV infection in the spread of HIV and implications for transmission prevention strategies in Lilongwe, Malawi: a modelling study. Lancet 378: 256–268. doi:10.1016/S0140-6736(11)60842-8.. Les hypothèses concernant cette durée ont évidemment un impact très fort sur les estimations de la contribution des infections récentes à l’incidence VIH globale. En 2012, dans un article de débat, deux groupes de scientifiques aux points de vue divergents se sont prêtés à cet exercice à partir de ces deux valeurs de durée d’hyper-transmissibilité. Ils sont arrivés à des estimations, pour le contexte africain, de contributions des infections récentes respectives de 2% (pour une période de d’hyper-transmissibilité durant 2 semaines) et 38% (pour une période de 5 mois); bien que ces estimations reposaient sur les mêmes données de comportements sexuels [4]. Dans le premier cas, la contribution minime des infections récentes ne remettrait pas en question l’efficacité estimée d’une stratégie de type Tester et Traiter. En revanche, dans le cas d’une contribution importante à l’épidémie (38% des nouvelles infections), un modèle précédemment utilisé montrait que cette stratégie ne suffirait pas à éradiquer l’épidémie.
Un impact à long terme?
Un travail récent de Jeaffrey Eaton et Timothy Hallett, de l’Imperial College (Londres), a tout récemment apporté de nouveaux éléments au débat6Eaton JW, Hallett TB (2014) Why the proportion of transmission during early-stage HIV infection does not predict the long-term impact of treatment on HIV incidence. Proc Natl Acad Sci: 201323007. doi:10.1073/pnas.1323007111.. Les deux modélisateurs ont posé la question légèrement différemment: ils n’ont pas tenté de quantifier la contribution « réelle » des infections récentes à l’épidémie globale, mais ont cherché à partir de quel niveau ces infections récentes pouvaient théoriquement menacer les résultats de stratégies reposant sur le TasPTasp «Treatement as Prevention», le traitement comme prévention. La base du Tasp a été établie en 2000 avec la publication de l’étude Quinn dans le New England Journal of Medicine, portant sur une cohorte de couples hétérosexuels sérodifférents en Ouganda, qui conclut que «la charge virale est le prédicteur majeur du risque de transmission hétérosexuel du VIH1 et que la transmission est rare chez les personnes chez lesquelles le niveau de charge virale est inférieur à 1 500 copies/mL». Cette observation a été, avec d’autres, traduite en conseil préventif par la Commission suisse du sida, le fameux «Swiss statement». En France en 2010, 86 % des personnes prises en charge ont une CV indétectable, et 94 % une CV de moins de 500 copies. Ce ne sont pas tant les personnes séropositives dépistées et traitées qui transmettent le VIH mais eux et celles qui ignorent leur statut ( entre 30 000 et 50 000 en France).
Les modélisateurs ont tenté de répondre à cette question à partir d’un modèle plus complet, prenant en compte les données de prévalences du VIH en Afrique du Sud sur près de 20 ans, et en autorisant une hétérogénéité et des modifications des comportements sexuels. Ce dernier facteur est d’importance, car on pense que les changements dans les pratiques sexuelles ont joué un rôle substantiel dans la diminution d’incidence du VIH qu’a connu l’Afrique du Sud au milieu des années 2000. Une fois ce modèle calibré pour coller au mieux aux courbes épidémiologiques observées de 1990 à 2008, les chercheurs ont fait varier la proportion des transmissions dues à des infections récentes et ont observé l’impact que cette proportion avait sur l’épidémie sous différentes hypothèses de couvertures ARV.
Les résultats semblent à première vue surprenant : dans le cas d’une très forte contribution des infections récentes à l’épidémie, les diminutions d’incidence due à l’effet TasP sont moindres dans les premières années suivant l’introduction des ARV. Mais, après 4 à 5 ans, les bénéfices attendus d’une intervention de type TasP semblent ne plus être affecté par la proportion des nouveaux cas dus aux infections récentes.
Pour comprendre ces résultats plutôt contre-intuitifs, il faut faire intervenir un paramètre essentiel en modélisation des maladies infectieuses : le chiffre de reproduction de base, R0R0 Le taux reproduction de base d’un virus ou R0, estime combien de personnes en moyenne sont infectées par une personne infectée. Supérieur à 1, il indique qu’un malade va infecter plus d’une personne et donc que l’épidémie va progresser. Inférieur à 1, les malades infectent moins de personnes et l’épidémie peut régresser. Ce chiffre correspond au nombre moyen de nouvelles infections qu’engendrerait un individu infecté dans une population naïve. Si ce chiffre est inférieur à 1, on s’attend à ce que l’épidémie s’éteigne d’elle-même. S’il est supérieur à 1, alors elle peut au contraire se maintenir. Le but d’une intervention de santé publique est justement de tenter de faire baisser ce chiffre de reproduction.
Qu’en est-il alors de ce R0 dans l’exercice de modélisation d’Eaton et Hallett ? Le fait de devoir reproduire fidèlement l’épidémie observée entre 1990 et 2008 impose une contrainte dans la relation ente ce R0 et la proportion de transmission en infection récentes : le R0 d’une épidémie portée majoritairement par des infections récentes sera plus faible que celui d’une épidémie portée minoritairement par des infections récentes. Or, une valeur moindre de R0 implique qu’une même intervention aura un plus grand impact. C’est cette relation entre R0 et contribution des infections précoces qui expliquent que la part des infections aigues dans une épidémie ne semble pas prédire le succès ou l’échec des stratégies basées sur le TasP.
Les essais randomisés de TasP et la détection des infections récentes
Cette conclusion à long terme semble rassurante, mais n’en n’oublions pas pour autant la conclusion sur le court terme : dans les 2 à 3 ans suivant une intervention de type TasP, les transmissions dues à des infections récentes peuvent réduire les bénéfices préventifs des ARV. Or, même brève, cette courte période de moindre efficacité dans un contexte hyper-endémique peut se traduire par un grand nombre de nouvelles infections. En outre, c’est justement sur des périodes courtes que les essais de TasP actuellement en court seront évaluées7Iwuji CC, Orne-Gliemann J, Tanser F, Boyer S, Lessells R, et al. (2013) Evaluation of the impact of immediate versus WHO recommendations-guided antiretroviral therapy initiation on HIV incidence: the ANRS 12249 TasP (Treatment as Prevention) trial in Hlabisa sub-district, KwaZulu-Natal, South Africa: study protocol for a cluster randomised controlled trial. Trials 14: 230. doi:10.1186/1745-6215-14-230.8Vermund SH, Fidler SJ, Ayles H, Beyers N, Hayes RJ (2013) Can combination prevention strategies reduce HIV transmission in generalized epidemic settings in Africa? The HPTN 071 (PopART) study plan in South Africa and Zambia. J Acquir Immune Defic Syndr 1999 63 Suppl 2: S221–S227. doi:10.1097/QAI.0b013e318299c3f4.. Ces résultats auront très certainement un impact sur les niveaux des financements internationaux pour les traitements ARV et la lutte contre l’épidémie.
Si les transmissions dues aux infections récentes ne semblent pas menacer les stratégies de type TasP à long terme, leur influence à court terme reste donc à considérer. Par ailleurs, au vu de résultats récents sur les bénéfices cliniques de traitement initiés très précocement9Des résultats récents montrent également un bénéfice individuel à un traitement initié très tôt au cours de l’infection à VIH. Cela pourrait permettre de réduire considérablement les réservoirs du VIH, et ainsi de laisser envisager des allègements thérapeutiques, voire même la possibilité d’une rémission fonctionnelle. L’un des prochains objectifs des stratégies de dépistage devraient donc être de dépister très précocement., on peut penser que le dépistage au plus proche de l’infection à VIH devrait devenir un enjeu de plus en plus important dans la lutte contre l’épidémie. Or, le défi est de taille. Des tests répétés tous les 3 à 6 mois seraient nécessaires afin d’espérer détecter des infections aiguës10Powers KA, Ghani AC, Miller WC, Hoffman IF, Pettifor AE, et al. (2011) The role of acute and early HIV infection in the spread of HIV and implications for transmission prevention strategies in Lilongwe, Malawi: a modelling study. Lancet 378: 256–268. doi:10.1016/S0140-6736(11)60842-8.. Une telle fréquence de dépistage semble difficile à mettre en place et à pérenniser. De plus, les tests de dépistage rapide, majoritairement utilisés en Afrique subsaharienne, présentent une moindre sensibilité durant la période d’infection aiguë 11Cohen MS, Gay CL, Busch MP, Hecht FM (2010) The detection of acute HIV infection. J Infect Dis 202 Suppl 2: S270–S277. doi:10.1086/655651.. Des tests de quatrième génération, plus sensibles aux infections aiguës, devraient cependant arriver prochainement sur le marché. Des stratégies comportementales ciblant les individus ayant récemment eu des comportements à risques et présentant des symptômes d’infection aiguë pourraient être envisagées, mais le manque de spécificité de ces symptômes pose également problème. On voit donc que la détection des infections récentes nécessite de nouvelles avancées, tant techniques que conceptuelles.